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发布时间:2022-06-10 08:45:00 作者:英瀚斯
LncRNA芯片
Long non-coding RNAs(lncRNAs)是一类转录本长度超过200 nt的功能性非编码RNA分子。分离培养:将产气发酵管培养物转种于伊红美蓝琼脂平板上,36士1°C培养18-24h,观察菌落形态。目前的研究已证实,lncRNA参与X染色体沉默,基因组印记以及染色质修饰,转录ji活,转录干扰,核内运输等多种重要调控过程。随着对lncRNA在哺乳动物进化及人类疾病发生和发展中作用的日益关注,lncRNA调控机制已成为当前遗传学研究的热点问题。
筛选出差异表达的lncRNA是研究其在人类疾病发生中所扮演角色的基础。富衡生物为用户提供高通量的lncRNA芯片进行lncRNA表达谱分析,该芯片基于Agilent的SurePrint技术生产,实验。
技术优势
信息覆盖广泛:覆盖了多个quan威lncRNA数据库发布的数据;提供人,小鼠,大鼠的lncRNA检测。
lncRNA和mRNA同时检测:芯片上包含有的lncRNA和新的mRNA序列检测探针。一次芯片实验可同时对lncRNA和mRNA进行分析。
平台成熟可靠:采用Agilent原位喷墨合成技术,了高检测灵敏度和特异性。
数据分析:提供lncRNA和mRNA表达谱差异分析和功能分析,以及二者的关联分析。
基因组甲l基化水平(Methyl ati on Content)的分析:
1.高l效液相色谱(Hi gh-performanceLi qui dChromatography, HPLC)HPLC是- -种比较传统的方法,是根据DNA或蛋白分子量和构象的不同而使其加以分离。基于此,STR分析法已经成为一种重要的鉴定分析方法,应用于法医学、qin子鉴定及细胞鉴定等领域。由于在动态相和静态相下分子的光吸收度并不相同而加以定量。随着系统的压强的增加,其分辨率增l高。故而能够定量测定基因组整体水平DNA甲l基化水平。该方法由Ruo等1980年首l次报道。过程是将DNA样品先经盐酸或氢l氟酸水解成碱基,水解产物通过色谱柱,结果与标准品比较,用紫外光测定吸收峰值及其量,计算5 mC/(5mC+5C)的积分面积就得到基因组整体的甲l基化水平。这是一种检测DNA甲l基化水平的标准方法。
2.高l效毛细管电泳法(Hi gh-per formance Capillary Electrophoresis, HPCE)这是一-种利用窄孔熔融石英毛细管来从复合物中分离不同化学组分的技术。于是,我们把位于染色体上某一区域的一组相关联的SNP等位位点称作单体型(haplotypeb大多数染色体区域只有少数几个常见的单体型(每个具有至少5%的频率),它们代表了一个群体中人与人之间的大部分多态性。其基础是在强电场下不同分子的由于其所带电荷,大小,结构以及疏水性等不同而相互分开。用HIPCE方法处理DNA水解产物来确定5mC水平,简便,经济且敏感性高。
活性氧检测试剂盒(Reactive oxygen species assay kit)是一种利用荧光探针DCFH-DA进行活性氧检测的试剂盒。如测序序列已知,可通过序列比较以星号标出差异碱基处,提高工作效率。DCFH-DA本身没有荧光,可以自由穿过细胞膜,进入细胞内后,可以被细胞内的酯酶水解生成DCFH。而DCFH不能通透细胞膜,从而使探针很容易被装载到细胞内。细胞内的活性氧可以氧化无荧光的DCFH生成有荧光的DCF。检测DCF的荧光就可以知道细胞内活性氧的水平。 本试剂盒提供了活性氧阳性对照试剂Rosup以便于活性氧的检测。Rosup是一种混合物(compound mixture),浓度为50mg/ml。
一、注意事项
1、探针装载后,一定要洗净残余的未进入细胞内的探针,否则会导致背景较高。
2、探针装载完毕并洗净残余探针后,可以进行激发波长的扫描和发射波长的扫描,以确认探针的装载情况是否良好。
3、尽量缩短探针装载后到测定所用的时间(刺激时间除外),以减少各种可能的误差。
4、为了您的安全和健康,请穿实验服并戴一次性手套操作。
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